Первым учебным заведением по подготовке фармацевтов была медицинская школа, открытая в Москве в 1706 г., в которой одной из дисциплин была фармацевтическая химия. Многие русские химики получили образование в этой школе.
Подлинное же развитие химической и фармацевтической науки связано в России с именем М.В. Ломоносова. По его инициативе в 1748 г. была организована первая научная химическая лаборатория, в 1755 г. открыт первый русский университет. М.В. Ломоносов указывал на единство химии и медицины: « .медик без довольного познания химии совершенен быть не может». Большой вклад в становление отечественной фармацевтической химии внесли: Т.Е. Ловиц (1757—1804) — открыл адсорбционные способности угля и применение его для очистки воды, спирта, винной кислоты, виноградного сахара, микрокристаллического анализа; В. М. Северин (1765—1826), который подчеркивал, что «без знания химии испытания лекарств предпринимать не можно». Его книги: «Способ испытывать чистоту и неподвижность химических произведений лекарственных» и «Способ испытывать минеральные воды» явились первыми отечественными руководствами в области исследования и анализа лекарственных веществ. А.П. Нелюбин (1785—1858), труды которого по праву называют «энциклопедией фармацевтических знаний», впервые сформулировал научные основы фармации, выполнил ряд прикладных исследований в области фармацевтической химии; усовершенствовал способы получения солей хинина; создал приборы для получения эфира и для испытания мышьяка. Было много и других ученых-химиков, которые внесли свой вклад в становление фармации и фармацевтической химии.
Первые химические школы и создание новых химических теорий в России. В подготовке кадров химиков и фармацевтов существенную роль сыграли первые химические школы, основателями которых были А.А. Воскресенский (1809— 1880) и Н.Н. Зинин (1812—1880), крупные ученые-химики. Первый провел ряд исследований, имеющих непосредственное отношение к фармации, — выделил алкалоид теобромин, уточнил химическую структуру хинина и др. Н.Н. Зинин открыл классическую реакцию превращения ароматических нитросоединений в ами-носоединения.
Мировую известность принесли России их достойные преемники Д.И. Менделеев (1834-1907) и А.М. Бутлеров (1828-1886). Периодическая система Менделеева и теория строения органических соединений Бутлерова оказали решающее влияние на развитие мировой химической науки. Оба ученых уделили внимание фармации и фармацевтической химии.
Исследования в области химиотерапии и химии природных веществ. Окончательным научным становлением фармацевтической химии можно считать конец XIX в., который ознаменовался зарождением новой эпохи в области лекарствоведения — химиотерапии. Одним из ее создателей был русский врач Г.Л. Романовский, который сформулировал принцип химиотерапии в 1891 г. Эти работы продолжил немецкий ученый П. Эрлих в области создания химиотера-певтических средств в ряду элементорганических соединений.
В это же время в России проведен ряд исследований по изучению природных веществ. Е.А. Шадский в 1889 г. издал монографию «Учение о растительных алкалоидах, глюкозидах и птомаинах», обобщившую исследования в области природных веществ, а чуть раньше (1885 г.) Ю. К. Трапп издал один из первых учебников по фармацевтической химии.
Из этого краткого исторического экскурса видно, что зародившаяся на заре цивилизации фармация, способствовала развитию химии, которая, развиваясь сама, уже влияла на развитие фармации, в недрах которой возникла самостоятельная отрасль химии — фармацевтическая химия.