Выявленные при инвентаризации расхождения фактического наличия имущества с данными бухгалтерского учета регулируются в соответствии со ст.12 Закона РБ от 18.10.1994 № 3321-XII «О бухгалтерском учете и отчетности» (в ред. Закона РБ от 25.06.2001 № 42-З). Стоимость недостачи, порчи или иной утраты лекарственных средств в пределах норм естественной убыли списывается по распоряжению руководителя организации на расходы. Нормы убыли могут применяться лишь в случаях выявления фактических недостач и только после зачета недостач излишками по пересортице. Если после зачета по пересортице все же оказалась недостача лекарственных средств, то нормы естественной убыли должны применяться только по тому наименованию лекарственных средств, по которому установлена недостача. Недостача (порча) лекарственных средств сверх норм убыли относится на виновных лиц, а при их отсутствии - на расходы организации.
Нормы естественной убыли и инструкция по их применению утверждены постановлением Минздрава РБ от 26.04.2000 № 7 «Об утверждении норм естественной убыли лекарственных средств, ваты и медицинских пиявок в аптечных учреждениях и предприятиях, инструкции по их применению». Нормы естественной убыли устанавливаются к стоимости индивидуально изготовленных лекарственных форм, внутриаптечной заготовки и фасовки.
К готовым лекарственным средствам промышленного производства нормы не применяются. Нормы естественной убыли ядовитых, наркотических лекарственных веществ и этилового спирта устанавливаются к стоимости израсходованного количества этих лекарственных средств по каждому наименованию. Естественная убыль лекарственных средств определяется исходя из нормы, установленной дифференцированно для аптек, не имеющих самостоятельного отдела запасов, и аптек с раздельной материальной ответственностью с выделением отдела запасов и рецептурно-производственного отдела.
Заведующий аптекой ведет также предметно-количественный учет лекарственных средств, подлежащих такому учету. Какие лекарственные средства подлежат предметно-количественному учету, определено Минздравом. В частности, особому предметно-количественному учету подлежат наркотические средства и психотропные вещества, включенные в Республиканский перечень. Предметно-количественному учету подлежат также другие дорогостоящие лекарственные средства (стоимостью свыше одной базовой величины). Перечень таких лекарственных средств утверждается медицинским советом организации здравоохранения (см. постановление Минздрава РБ от 06.12.2000 № 53 «О правилах выписывания рецептов и отпуска населению лекарственных средств»).
Предметно-количественный учет лекарственных средств (кроме наркотических средств и психотропных веществ) ведется в книге предметно-количественного учета медикаментов формы 8-МЗ, страницы которой должны быть пронумерованы и заверены подписью главного бухгалтера (п.15 Инструкции № 747). Предметно-количественный учет наркотических средств и психотропных веществ ведется в журнале предметно-количественного учета наркотических средств и психотропных веществ в аптеках (приложение 6 к Инструкции № 51). Основанием для ведения предметно-количественного учета являются документы поставщиков, накладные-требования, которыми оформляется выдача лекарственных средств в отделения (кабинеты), акты и т.д. При этом накладные-требования предварительно регистрируются в ежедневно составляемой ведомости выборки израсходованных лекарственных средств, подлежащих предметно-количественному учету (форма 1-МЗ), в которой записи ведутся по каждому наименованию отдельно. Итоги выборки за день по каждому наименованию лекарственных средств переносятся в формы предметно-количественного учета.